El Gobierno del Perú fue admitido como Estado Miembro de la OIM, a fines de 1966 y el 01 de abril de 1969, mediante el Decreto Ley No. 17559, aceptó la Constitución de la OIM.

La Misión en Lima comenzó en 1967 y fue designada como Misión con Funciones Regionales para los Países de la Comunidad Andina años más tarde. Actualmente, OIM Lima continúa trabajando bajo la premisa de fomentar una migración ordenada y humana en beneficio de los migrantes peruanos y de la sociedad. En esta línea, despliega iniciativas de asistencia, apoyo técnico y asesoramiento al gobierno central, gobiernos regionales, ciudadanos e instituciones en todos los aspectos relacionados a la gestión migratoria y a la defensa de los derechos humanos de los migrantes.

Asimismo, busca consolidar la capacidad de los gobiernos y otras entidades involucradas en el quehacer migratorio a fin de satisfacer los desafíos que plantea este fenómeno de manera exhaustiva, cooperativa y en última instancia, autosuficiente. A la par, como oficina con funciones regionales, sirve como centro de apoyo para las misiones en Ecuador, Venezuela y Bolivia.