La OIM abrió su Oficina en Ecuador en 1965 y desde esa fecha viene trabajando en las áreas de cooperación técnica, defensa de los derechos humanos del migrante y retorno asistido. La Oficina ha sido estos últimos años escenario de varios proyectos piloto entre los que destacan la iniciativa de Migración Ordenada para enviar trabajadores a España y el programa de modernización de pasaportes que ha permitido a este país contar con uno de los pasaportes más modernos del mundo. Aproximadamente, un 25% de los ecuatorianos ha migrado y reside en un país tercero.