Los programas de OIM en Ecuador se enmarcan dentro de las cuatro principales esferas de gestión de la migración, que maneja OIM a nivel mundial.

1.- Reglamentación de la Migración
2.- Migración Facilitada
3.- Migración Forzada
4.- Migración y Desarrollo

La OIM - Ecuador cuenta con una oficina central en la ciudad de Quito y 3 oficinas de campo, en las ciudades de San Lorenzo, provincia de Esmeraldas; Tulcán, provincia del Carchi;  Lago Agrio, provincia de Sucumbíos.