En su calidad de líder de la agrupación de la comunidad internacional encargada de cuestiones de albergue en los empeños humanitarios, la OIM tiene a su cargo la coordinación de la respuesta de emergencia para ofrecer albergue, y también se ocupa del transporte terrestre para los interlocutores humanitarios en el terreno, de las evacuaciones médicas y de otras actividades de salud conexas.

En Ecuador, la OIM forma parte del Equipo de Emergencias del Sistema de Naciones Unidas, UNETE, y ha participado en actividades de respuesta de emergencia en situaciones de desastres naturales en el Ecuador. En la erupción del volcán Tungurahua a mediados del 2006, la OIM envío un equipo de valoración compuesto por especialistas de agua, saneamiento y ambiente, quienes brindaron su asistencia técnica para la recuperación de los sistemas de agua destruidos por la erupción y la acumulación de ceniza.

En febrero 2008, en la emergencia por las inundaciones en la costa ecuatoriana, la OIM como la agencia líder en lo que respecta a albergues, ha trabajado en coordinación con representantes de las Fuerzas Armadas, el Ministerio de Inclusión Social y Economía, el Ministerio del Litoral y el Ministerio de Desarrollo Urbano y de Vivienda, así también con el Equipo Técnico de Emergencia de Naciones Unidas. La OIM ha brindado asistencia técnica para la planificación, identificación y provisión de albergues temporales para la población afectada.